柴井基督医院坐落于北门附近的圣公会建筑群(compound)中,创建于1898年,宫维贤(Dr George Wilkinson)受教会派遣担任第一任院长,起初只设女部,1905年增建男部。1901年,教会在北大路隔街对面(西侧)购地建起医院附设护士学校,至1920年按规范改名为私立柴井高级护士职业学校。1929年,医院名称由柴井医馆正式定名为柴井基督医院。1944年福州市第二次沦陷时,曾被日军占为北区司令部。1952年,福州市人民政府接办医院,改名为福州市立医院。1956年,再改名福州市立第一医院,1969年迁至原合组医院院址(即现址),原址现为福建省公安厅使用。
1898年,英国圣公会福建教区会吏长胡约翰(John Richard Wolfe)在北门内柴井购入一块山地,建起圣公会在1878年乌石山教案中被逐出城后的第一个城内传教基地,包括一座女传教士住宅、一座医生住宅、一座女子学校、基督教道源堂、灵光男童盲校和柴井医院。
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据《福州市宗教志》记载,柴井医院1894年由宝韦护士(Miss Margaret Ellen Baldwin)创建,而根据胡约翰的女儿、同样在福州工作的圣公会传教士Ann Muriel Wolfe的报告记载,1901年宝韦护士才到福州开始工作,故可以将医院建立时间认定至1898年后。随着前来问诊的信徒和其他居民日渐增多,1905年,医院新楼竣工,正式分为男、女二部。医院由五座病房组成,分别以香港主教霍约瑟(Joseph Charles Hoare)、福建教区会吏长胡约翰(John Richard Wolfe)、圣公会派往福州的第一位教会医生温敦(William Welton)、第一次鸦片战争中的英国全权代表义律(Charles Elliot)(存疑)命名。 据《福州市志》记载,1929年医院名称正式定为柴井基督医院(Cha-Chang Christ's Hospital)。根据1949年医院平面图,此时已建成四座病房、一座院长公馆、一座护士长公馆、三座医生宿舍和其他若干辅助建筑。